盡管南京蜂窩紙箱具有廣闊的市場前景，但其現在的發展狀況并沒有想象中那么樂觀，主要存在以下幾方面困惑和挑戰。

  1、產品功能有待提高

  從蜂窩紙箱本身功能上來看，多位受訪者表示蜂窩紙箱存在一個致命的弱點，即防水、防潮功能較差。現在，即使大部分出口商品包裝采用的蜂窩紙箱經過防水、防潮處理，但受運輸環境的影響，蜂窩紙箱受潮或遇水嚴重后各項物理功能指標都會隨之下降，導致內裝商品受損，從而形成一定的經濟損失。另外，蜂窩紙箱的強度也是一大擔憂，尤其是戳穿強度和邊壓強度還有待提高。因而，現在蜂窩紙箱只能在某一范圍內替代木箱包裝，并不是完全取代。

  2、認識上的缺乏

  提出要強化運用“ 以紙代木”包裝已有三年之久，但現在的進展速度較為緩慢，尤其是在蜂窩紙箱的推廣上。其中，最主要的原因就是人們對蜂窩紙箱的了解還不夠，乃至存在一些誤解和偏見。首當其沖就是終端用戶的認識缺乏，他們普遍認為紙質包裝的功能不及木質包裝，而且關于節材代木的環保意識也比較薄弱。采訪中有一些尚未采用蜂窩紙箱的終端用戶就清晰表示，他們不愿意承擔風險來改變現有的包裝形式。

 3、生產成本高

  蜂窩紙箱成本偏高也是不容忽視的一大問題。要想確保蜂窩紙箱具有較高的強度，就必須采用進口高定量原紙或優質原紙，這樣勢必會添加原材料成本；如果制作工藝較為落后，蜂窩紙箱生產過程的損耗也會較高，一般，以一般瓦楞紙板損耗10%計算，重型瓦楞紙板將損耗20%，這樣生產制形成本將會相應添加。如此一來，蜂窩紙箱的綜合成本就大大添加。